Estudio de la fase larvaria planctónica del pulpo común, octopus vulgaris cuvier, 1797 frente a distintas condiciones de cultivo mediante el empleo de tecnologías ómicas e identificación de genes biomarcadores

Abstract

El pulpo común (Octopus vulgaris) reúne las características ideales para su introducción como nueva especie en la acuicultura. Actualmente en Galicia (NO España) se lleva a cabo el engorde de pulpos capturados de las poblaciones naturales. Sin embargo, debido a la elevadísima tasa de mortalidad producida durante los primeros estadios de desarrollo (paralarvas) se produce un cuello de botella que impide completar su ciclo de vida en cautividad, lo cual impide su implantación en la acuicultura. La investigación alrededor de este problema se ha centrado aspectos zootécnicos y en aspectos nutricionales, sin embargo, hay relativamente pocos estudios moleculares y genéticos en esta especie (teniendo en cuenta su relevancia científica y económica), especialmente en las paralarvas. Otro punto importante a tener en consideración son las cuestiones relacionadas con sus condiciones de bienestar (bajo cultivo) las cuales tampoco han sido objeto de adecuados estudios moleculares y funcionales. Nuestra propuesta con este proyecto de tesis es profundizar mediante análisis a partir de datos masivos, relativos a la expresión de genes y proteínas, en el estudio de los primeros estadios de desarrollo del pulpo común (paralarvas) crecidas bajo diferentes condiciones de cultivo (referidas a dieta y temperatura) con el fin de lograr una mayor comprensión de los procesos biológicos que ocurren en estas primeras etapas de vida, e identificar genes biomarcadores que puedan ser usados para ayudar a optimizar el cultivo. Este enfoque será posible gracias al uso de técnicas ¿ómicas¿ de secuenciación masiva enfocada a la genética (RNA-seq) y a la proteómica (SWATH), que nos permitirá obtener transcriptomas específicos y solventar la ausencia de un genoma de referencia. Además, las condiciones ambientales y nutritivas regulan la transcripción de genes a través de mecanismos epigenéticos subyacentes sin alterar la secuencia del genoma. Estos mecanismos pueden jugar un papel en la regulación del desarrollo temprano del pulpo afectando a su crecimiento, supervivencia y salud; tal y como se ha visto que hacen en otros moluscos. En conjunto este nuevo enfoque abre nuevas expectativas para aumentar la eficiencia del cultivo.