Desarrollo y aplicaciones de modelos de evolución de proteínas

Resumo

Los modelos de evolución de proteínas permiten comprender la evolución de las proteínas que se observan en el presente. Una aplicación interesante de los modelos de evolución de proteínas, entre sus diversas aplicaciones, consiste en comprender la evolución de proteínas de patógenos que se utilizan frecuentemente como dianas moleculares de terapias. En este sentido, considerar la evolución de estas proteínas puede proporcionar pistas útiles para el diseño de terapias que sean más efectivas ante la aparición de mutaciones de resistencia. Para ello es fundamental el uso de modelos realistas de evolución de proteínas y esto requiere la mejora de modelos actuales y el desarrollo de modelos nuevos. Tradicionalmente, la mayoría de las inferencias evolutivas a partir de datos de proteínas están basadas en modelos empíricos de evolución que asumen que los sitios de una proteína evolucionan independientemente y mediante un mismo proceso de sustitución. Sin embargo, se sabe que las propiedades estructurales y fisicoquímicas de cada sitio afectan a su evolución. En esta tesis doctoral se pretende mejorar, desarrollar y evaluar modelos de evolución de proteínas (incluyendo modelos de codones), con especial interés en proteínas de virus que son dianas moleculares de terapias.